Мотоко Кусанаги, освободившись от своих обязанностей в подразделении 501, сталкивается с новой реальностью, где ей необходимо подчиняться приказам Арамаки. В это время происходит взлом систем безопасности государственной службы, и Бато решает

Фильм "Mass Effect: Утерянный Парагон" рассказывает о начале службы офицера Альянса Джеймса Веги. Он присоединяется к элитному спецназу в период, когда человечество сталкивается с новой, загадочной угрозой, известной как Коллекционеры.